وعلى الرغم من علاقاته الطيبة مع كل الفنانين أنتشر في الفترة الاخيرة ان خوري أصبح يختلق الخلافات بينه و بين زملائه وكذلك رفع أسعار الحانه جداً، فحول خلافه مع الفنانة اللبنانية نورهان يقول مروان "كل الموضوع أنني صريح جداً و عندما سئلت في احدي المحطات الفضائية عن أغنية "من زمان" التي لحنتها لنورهان، قلت أني غير راضى عن النتيجة التي سجلت وظهرت بها الأغنية بسبب تصويرها السيئ وأداء نورهان الفاتر لها و هذا صحيح و هو رأيي".
و عن رفضة التلحين لهيفاء وهبي قال "أنا غير مستعد لإعطاء لحن لهيفا و ذلك لأني لا أملك لحن يليق لهيفاء أو لصوتها و هذا الموضوع لم ينتج عنه اي خلاف لأن هيفاء نفسها تقول أن مروان موهوب وألحانه جميلة ، لكن بكل اسف "ستايلي مش عنده".
و عن أكثر الأصوات التي كان يحلم بالتلحين لها يقول خوري "أحلم فعلا بأنه لو كان بإمكاني تقديم لحن للسيدة فيروز، أو لوديع الصافي.. أحلم بصوت عبد الحليم.. أحلم بصوت من تلك الأصوات التي ترغم الملحن على تقديم أجمل ما عنده
و عن رفضة التلحين لهيفاء وهبي قال "أنا غير مستعد لإعطاء لحن لهيفا و ذلك لأني لا أملك لحن يليق لهيفاء أو لصوتها و هذا الموضوع لم ينتج عنه اي خلاف لأن هيفاء نفسها تقول أن مروان موهوب وألحانه جميلة ، لكن بكل اسف "ستايلي مش عنده".
و عن أكثر الأصوات التي كان يحلم بالتلحين لها يقول خوري "أحلم فعلا بأنه لو كان بإمكاني تقديم لحن للسيدة فيروز، أو لوديع الصافي.. أحلم بصوت عبد الحليم.. أحلم بصوت من تلك الأصوات التي ترغم الملحن على تقديم أجمل ما عنده